同じような内容について以下で書きました。
Sonomaさん(のQuickTime Player)でmp4ファイルが再生できない理由がいまさらわかった... - memorandums
この状況は今も変わらずです。
ちょっと前まではHandBreakでいちいち変換していました。GUIを起動するのが面倒なので最近はffmpegで変換しています。
ただ、動画が複数あるとちょっと面倒です。
そんなときの話しです。
同一フォルダ内にmp4ファイルが複数あった場合に、まとめて変換するのが以下です。
ls *mp4 | xargs -I {} ffmpeg -i {} "../{}"
xargsの使い方って全然覚えられません。。。LinuxとMacも違うようで。。。まぁいいか。調べれば解決するし。